Saison 3

C'est la rentrée. Après le calme des vacances d'été, nos héros ne tardent pas à devoir affronter XANA à nouveau.

Il est temps d'élire les délégués de classe. Jérémie, persuadé qu'Hervé sera son unique adversaire, est certain d’être élu.

XANA a trouvé un moyen de faire monter le niveau de la mer numérique, « inondant » ainsi Lyoko et bloquant l'accès des héros au Cinquième Territoire.

Une agence gouvernementale ultra secrète découvre que Jérémie a piraté son système informatique.

Aelita a du mal à accepter la disparition de son père. Elle se confie à Jérémie et lui fait part de ses doutes : et si Franz Hopper était toujours en vie quelque part ?

Johnny, l'ami d'Hiroki, a le béguin pour Yumi. Timide et inexpérimenté, il a besoin de conseils pour la séduire.

Après avoir croisé Yumi en pleine nuit dans la rue, William est déterminé à découvrir ce qu'elle manigance !

Ulrich et Odd sont victimes d'un étrange phénomène : bien qu'ils soient de retour dans le monde réel, ils sont persuadés d'être toujours sur Lyoko.

Jérémie remarque qu'un homme sous l'emprise de XANA a saboté le supercalculateur. Ce dernier sera irrémédiablement détruit si Jérémie ne le répare pas rapidement.

Jérémie pense avoir enfin trouvé le moyen de virtualiser ses amis directement dans le Cinquième Territoire. Ulrich est désigné pour jouer les cobayes.

Odd est frustré : Ulrich, Aelita et Yumi ont tous les deux des pouvoirs spéciaux, tandis que lui n'a rien, à part ses minables flèches laser.

Nos héros sont épuisés. Ils passent leur temps à lutter contre XANA, ce qui a des conséquences désastreuses sur leurs résultats scolaires.

William a rejoint la bande des Lyoko-guerriers. Il a hâte d'affronter XANA et les monstres virtuels pour la première fois !