Saison 2

Peter et Neal sont sur la piste d'un voleur professionnel répondant au pseudonyme de l'Architecte, sur le point de s'attaquer à l'une des banques les plus prestigieuses de New York. Peter et Neal vont devoir contrecarrer ses plans. Dans le même temps, tous deux constatent que l'agent Fowler a disparu et que l'opération Mentor a été couverte par la hiérarchie. Peter et Diana espèrent que les données laissées par Fowler leur permettront de savoir qui se trouve derrière cette sombre affaire...

Peter demande à Neal d'infiltrer l'entourage d'un sénateur corrompu afin de le prendre en faute. Pendant ce temps, Peter et Diana tentent de retrouver le responsable de l'explosion de l'avion qui a coûté la vie à Kate...

Quand le vol d'une célèbre toile fait la une des journaux, Neal et Peter pensent qu'ils ont affaire à un malfaiteur qui s'inspire du passé criminel de Neal et de ses techniques personnelles pour commettre ses larcins. Ils tentent aussitôt d'identifier cet audacieux criminel. Mais celui-ci n'a pas laissé beaucoup d'indices. Le FBI mobilise tous ses moyens car le temps presse : le tableau pourrait être vite revendu...

Mozzie cherche de l'aide auprès de Neal pour retrouver son amie qui a été kidnappée. Devant la tournure que prennent les événements, Mozzie va devoir accepter le concours de Peter, et donc, du FBI, ce qui ne l'enchante guère. Les deux équipes tentent de recueillir suffisamment d'indices pour localiser le criminel et savoir si sa victime est toujours en vie. Le malfaiteur n'a guère laissé de preuves derrière lui...

Alors que le FBI enquête sur un vol, Neal découvre que l'homme qu'il suspecte est en réalité un tueur à gages. Le meurtrier a été payé pour assassiner Sara Ellis, la femme chargée par la société d'assurances d'enquêter sur l'affaire...

Peter et Neal enquêtent sur un avocat, qui extorque des centaines de milliers de dollars aux familles adoptantes pour lesquelles il travaille. Les investigations prennent un tournant inattendu quand il s'avère que l'homme de loi est lié à un grand caïd de la mafia russe. Peter et Neal sont alors exposés à de graves dangers : les criminels ne plaisantent pas avec les représentants de la loi...

Peter est convaincu de l'innocence d'un collègue du FBI, accusé de vendre la liste des caches secrètes des témoins protégés. Quand les preuves accusent le chef du bureau de l'US Marshall, Peter fait tout pour l'innocenter devant la cour. Ce faisant, il prend des risques pour sa carrière. Il semble toutefois sûr de lui, mais manque de preuves pour étayer sa théorie. Il est sommé de s'expliquer...

Peter infiltre le milieu de l'espionnage industriel après que le chef du service Recherche d'une entreprise spécialisée en technologies sensibles a été retrouvé mort...

Peter et Neal trouvent un indice-clé pour élucider le mystère qui entoure la mort de Kate. Neal élabore un plan pour se retrouver face au meurtrier...

Mozzie échappe de justesse à la mort et Neal se sert de ses contacts pour aider Peter à retrouver la personne qui a tiré sur Mozzie. Il s'agit d'un certain Julian Larssen. Le piège qu'ils montent pour tenter d'arrêter ce dernier se retourne finalement contre Peter, qui se retrouve suspendu du FBI...

Face au casse-tête que constitue l'enquête sur la mort de Kate, Peter et Neal concluent un accord : le temps d'une nuit, Peter gracie Neal de ses actes en échange de ce qu'il sera capable de lui apprendre sur Vincent Adler du temps de leur collaboration...

Le fils d'un diplomate est détenu en Birmanie pour un crime qu'il affirme ne pas avoir commis. Peter et Neal s'immiscent alors dans le monde exotique mais dangereux de la haute-joaillerie, afin de prouver son innocence. Mais quand le gouvernement birman entrave leur enquête en invoquant les lois internationales, il ne reste plus aux deux équipiers qu'à utiliser ces mêmes lois à leur propre avantage.

Un vieil ami du mari de June débarque chez Neal. Celui-ci le soupçonne d'être là pour autre chose qu'en souvenir du bon vieux temps. Ford Tullman, qui vient de sortir de prison, est décidé à prendre un nouveau départ. En tant qu'ancien criminel, tout comme lui, Neal veut lui laisser une chance mais il réalise que cela est difficile quand il retrouve caché, chez June, un plateau d'une valeur inestimable...

Pris dans un guet-apens, Peter est kidnappé par l'ancien rival de Neal, Matthew Keller. Pour le faire tomber, Neal doit alors s'associer à contrecoeur au rival de Keller...

Peter et Neal doivent échanger leurs identités pour infiltrer un groupe de malfaiteurs, à l'origine de plusieurs black-out dans New York. Ce changement de rôles n'est pas sans causer quelques troubles au sein du duo de choc...

Neal se retrouve face à l'homme responsable de la mort de Kate. Il découvre également la vérité à propos d'une grosse affaire, lorsque, avec Peter, il met la main sur un sous-marin allemand, jusqu'alors disparu...